病毒研究中的超算知识
2020-02-07 14:47 作者：donggang 浏览量：
迎战疫情,艾锑无限用爱与您同行
为中国中小企业提供免费IT外包服务
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这次的肺炎疫情对中国的中小企业将会是沉重的打击，据钉钉和微信两个办公平台数据统计现有2亿左右的人在家远程办公，那么对于中小企业的员工来说不懂IT技术将会让他们面临的最大挑战和困难。
电脑不亮了怎么办？系统蓝屏如何处理？办公室的电脑在家如何连接？网络应该如何设置？VPN如何搭建？数据如何对接？服务器如何登录？数据安全如何保证？数据如何存储？视频会议如何搭建？业务系统如何开启等等一系列的问题，都会困扰着并非技术出身的您。
好消息是当您看到这篇文章的时候，就不用再为上述的问题而苦恼，您只需拨打艾锑无限的全国免费热线电话:400 650 7820，就会有我们的远程工程师为您解决遇到的问题，他们可以远程帮您处理遇到的一些IT技术难题。
如遇到免费热线占线，您还可以拨打我们的24小时值班经理电话:15601064618或技术经理的电话:13041036957，我们会在第一时间接听您的来电，为您提供适合的解决方案，让您无论在家还是在企业都能无忧办公。
那艾锑无限具体能为您的企业提供哪些服务呢？
艾锑无限始创于2005年，历经15年服务了5000多家中小企业并保障了几十万台设备的正常运转，积累了丰富的企业IT紧急问题和特殊故障的解决经验，制定了相对应的解决方案。我们为您的企业提供的IT服务分为三大版块:
第一版块是保障性IT外包服务:如电脑设备运维，办公设备运维，网络设备运维，服务器运维等综合性企业IT设备运维服务。
第二版块是功能性互联网外包服务:如网站开发外包，小程序开发外包，APP开发外包，电商平台开发外包，业务系统的开发外包和后期的运维外包服务。
第三版块是增值性云服务外包:如企业邮箱上云，企业网站上云，企业存储上云，企业APP小程序上云，企业业务系统上云，阿里云产品等后续的云运维外包服务。
您要了解更多服务也可以登录艾锑无限的官网:www.bjitwx.com查看详细说明，在疫情期间，您企业遇到的任何困境只要找到艾锑无限，能免费为您提供服务的我们绝不收一分钱，我们全体艾锑人承诺此活动直到中国疫情结束,我们将这次活动称为——春雷行动。
以下还有我们为您提供的一些技术资讯，以便可以帮助您更好的了解相关的IT知识，帮您渡过疫情中办公遇到的困难和挑战，艾锑无限愿和中国中小企业一起共进退，因为我们相信万物同体，能量合一，只要我们一起齐心协力，一定会成功。再一次祝福您和您的企业，战胜疫情，您和您的企业一定行。
北京艾锑无限告诉您：病毒研究中的超算知识
新冠病毒在2019-2020爆发，很快我们就知道了它的样子。相信关心疫情的人都看过下面这张病毒的“正面照”，那么它是如何被绘制出来的呢？
要对病毒进行绘制需要拍摄---数据采集---图像处理---三维重构---结构分析等步骤，流程如下图：
许多电镜三维重构程序目前是实现的任务级别的并行，如BSOFT、FREALIGN、IMOD和PRIISM/IVE等。而AUTO3DEM、IMAGIC、UCSFTOMOgraphy等则完全采用了MPI并行方式。著名的单颗粒三维重构软件EMAN目前所有的并行手段都已经实现，SPIDER和IMIRS程序则采用了OpenMP和MPI并行方式，但SPIDER保留了任务级的并行方式，而IMIRS程序没有。XMIPP则采用了MPI和pthreads方式。
通过上面的分析，可以发现冷冻电镜三维重构的高性能计算IT需求归纳为以下几部分：
•主要为浮点计算，其中有大量的单精度或双精度快速傅里叶（FFT）计算。
•软件内存需求和I/O需求大，一般都需要配置并行文件系统。
针对傅里叶（FFT）计算，目前主流大量采用nVidia GPU是行业惯例，nVidia CUDA为开发人员提供了多种库，其中cuFFT库则是CUDA中专门用于进行傅里叶变换的函数库。“cuFFT”全称是CUDAFast Fourier Transform，顾名思义，它提供了一系列的函数帮助开发者进行快速傅里叶变换的运算。
cuFFT库由两个子库构成，它们分别是CUFFT和CUFFTW。CUFFTW库是一个移植工具（portingtool），它为用户提供了一些接口，以使得用户使用FFTW库（一个非常流行的CPU快速傅里叶变换库）编写的程序能够运行在CUDAGPU上。而CUFFT则是纯CUDA接口的快速傅里叶变换库。
针对高性能计算文件系统，业界解决方案有很多：Lustre、BeeGFS、分布式横向扩展NAS等等。
艾锑无限在大规模计算集群上有多年工作经验，部署架设过众多运算集群环境。有着丰富的部署经验。竭诚为有大量超算需求的企事业单位服务
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